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Protein Homology Detection Through Alignment of Markov Random Fields: Using MRFalign - Jinbo Xu,Sheng Wang,Jianzhu Ma - cover

LIBRO INGLESE

Protein Homology Detection Through Alignment of Markov Random Fields: Using MRFalign

Name: Protein Homology Detection Through Alignment of Markov Random Fields: Using MRFalign
Price: 69.30 EUR
Availability: InStock
Author: Jinbo Xu
ISBN: 331914913X

di Jinbo Xu (Autore)

Sheng Wang (Autore)

Jianzhu Ma (Autore)

Springer International Publishing AG, 2015

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Descrizione

This work covers sequence-based protein homology detection, a fundamental and challenging bioinformatics problem with a variety of real-world applications. The text first surveys a few popular homology detection methods, such as Position-Specific Scoring Matrix (PSSM) and Hidden Markov Model (HMM) based methods, and then describes a novel Markov Random Fields (MRF) based method developed by the authors. MRF-based methods are much more sensitive than HMM- and PSSM-based methods for remote homolog detection and fold recognition, as MRFs can model long-range residue-residue interaction. The text also describes the installation, usage and result interpretation of programs implementing the MRF-based method.

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Dettagli

Autore:

Jinbo Xu, Sheng Wang, Jianzhu Ma

Editore:

Springer International Publishing AG

Collana:

SpringerBriefs in Computer Science

Anno:

2015

Rilegatura:

Paperback / softback

Pagine:

51 p.

Testo in English

Dimensioni:

235 x 155 mm

EAN:

9783319149134

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